Gli strumenti idraulici progettati per essere immersi nell'acqua vengono chiamati strumenti idraulici subacquei. Tali strumenti sono necessari per la costruzione di strutture marittime, la manutenzione di imbarcazioni e altre attività di recupero. Questi strumenti sono costruiti con materiali resistenti alla ruggine per una protezione nelle acque profonde. È comune che gli strumenti idraulici subacquei richiedano unità di potenza specializzate impermeabili e in grado di funzionare a diverse altezze, rendendo possibile il loro utilizzo al di sotto della superficie dell'acqua.